《超级公务员》是一部融合了职场奋斗与奇幻设定的热血漫画。主角陈锋本是基层公务员，意外绑定“超级办公系统”，通过完成各种奇葩任务（如调解时空错乱的邻里纠纷、处理来自异界的信访件）获得超凡能力。他一边在现实世界中稳步升迁，为百姓办实事，一边揭露隐藏在政府体系背后的神秘组织，逐渐成为连接人间与异界的核心枢纽，用另一种方式守护着世界的秩序与和平。
陈锋接到系统最高级别任务：协助一位来自仙女座星系的外星居民办理“星际暂住证”。面对完全陌生的法律条文和生理构造，他凭借过人的耐心与智慧，最终成功办结，为地球与星际文明建交打下了基础。
一位来自未来的老者投诉“现在”的河道规划影响了他那个时代的生态。陈锋通过系统开启时空视界，发现是开发商偷工减料，他巧妙利用政策漏洞，勒令其整改，既解决了未来的隐患，又保护了现在的环境。
国内突然涌现出一批拥有超能力的“异能者”，他们的社会福利问题成为烫手山芋。陈锋设计出一套全新的“异能者社保体系”，将危险系数纳入工伤评定，成功安抚了躁动的异能者群体，避免了社会动荡。
系统检测到某高官体内存在“贪婪原虫”，这是一种能放大人类欲望的异界寄生虫。陈锋假借常规审计之名，深入虎穴，不仅清除了原虫，更顺藤摸瓜，揭开了一个庞大的贪腐网络，肃清了政治生态。
年末将至，系统发布“完美年终总结”任务。陈锋发现他这一年的所有任务记录都是最好的素材。他将调解异界纠纷、处理超自然事件与本地经济发展数据结合，写出了一份惊世骇俗却又无比真实的总结，惊动高层。
陈锋刚通过公务员考试，在档案室整理旧卷宗时，意外被一束光吸入，绑定了“超级办公系统”。系统的第一个新手任务，竟是“请在十分钟内，平息隔壁办公室因茶水间咖啡机引发的时空扭曲事件”。